Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms