Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms