Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN11AQ9UI33 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms