Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms