Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CABP1Q9NZU7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms