Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms