Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXL2Q9NZ53 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms