Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA3Q9NZ52 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms