Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms