Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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