Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms