Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms