Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms