Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDP1Q9NUW8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDP1Q9NUW8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TDP1Q9NUW8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TDP1Q9NUW8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TDP1Q9NUW8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDP1Q9NUW8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms