Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM7SF3Q9NS93 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms