Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUOX1Q9NRD9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms