Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms