Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN3Q9NQT6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms