Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ94

A1CF, APOBEC1 complementation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1CFQ9NQ94 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A1CFQ9NQ94 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A1CFQ9NQ94 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A1CFQ9NQ94 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A1CFQ9NQ94 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A1CFQ9NQ94 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A1CFQ9NQ94 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A1CFQ9NQ94 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A1CFQ9NQ94 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1CFQ9NQ94 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms