Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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