Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FANCFQ9NPI8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FANCFQ9NPI8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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