Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX2Q9NPC8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms