Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms