Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms