Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms