Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC52A2Q9HAB3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC52A2Q9HAB3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms