Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKRIP1Q9H875 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms