Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAS3Q9H6U6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms