Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Z3

PCIF1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCIF1Q9H4Z3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCIF1Q9H4Z3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCIF1Q9H4Z3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCIF1Q9H4Z3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCIF1Q9H4Z3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCIF1Q9H4Z3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCIF1Q9H4Z3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCIF1Q9H4Z3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCIF1Q9H4Z3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCIF1Q9H4Z3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCIF1Q9H4Z3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCIF1Q9H4Z3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PCIF1Q9H4Z3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCIF1Q9H4Z3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms