Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDCBP2Q9H190 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms