Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BHLHE41Q9C0J9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms