Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL4Q9C0H6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL4Q9C0H6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms