Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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