Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIFKQ9BYG3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms