Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDHR2Q9BYE9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR2Q9BYE9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms