Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms