Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL6Q9BWW8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL6Q9BWW8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms