Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms