Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPOQ9BU64 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms