Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms