Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNPY3Q9BT09 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNPY3Q9BT09 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNPY3Q9BT09 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNPY3Q9BT09 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNPY3Q9BT09 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNPY3Q9BT09 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNPY3Q9BT09 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNPY3Q9BT09 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNPY3Q9BT09 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNPY3Q9BT09 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNPY3Q9BT09 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms