Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms