Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MESP1Q9BRJ9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms