Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3CQ99985 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEMA3CQ99985 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEMA3CQ99985 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms