Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN18Q99952 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN18Q99952 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN18Q99952 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN18Q99952 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN18Q99952 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN18Q99952 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN18Q99952 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms