Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms