Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SORT1Q99523 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms