Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85AQ96PX6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms