Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GBP4Q96PP9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP4Q96PP9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms