Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms